病毒学报

2021, v.37(03) 596-604

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辽宁省首次从急性弛缓性麻痹(AFP)病例分离的一株人腺病毒1型重组株的全基因组序列特征分析
Full-length Genome Analysis of The Recombinant Human Mastadenovirus Type-1 Strain Isolated from Patients with Acute Flaccid Paralysis (AFP) in Liaoning Province,China

邵玉平;王作虪;任丽萍;陈涛;方兴;任毅;郝爽;王文思;姚文清;

摘要(Abstract):

人腺病毒(Human mastadenoviruses,HAdV)是一种常见的病毒病原体,在儿科患者中普遍存在。本研究首次报道了2017年从辽宁省急性弛缓性麻痹(AFP)病例的粪便标本中分离到的一株人腺病毒1型重组株LN2017,并对其全基因组进行测序和分析。我们首先测定了LN2017的全基因组序列,并将其与从GenBank数据库中下载的来自8个国家的38个参考株一起,构建了基于全基因组、Hexon基因,Penton base基因,Fiber基因和E3基因的系统发育树,并用RDP4.97和SimPlot3.5.1软件进行了重组分析。结果显示,LN2017病毒为HAdV-C亚属,其Hexon,Penton base和Fiber基因与HAdV-1高度相似,但是其E3基因和HAdV-2、HAdV-6高度相似。重组分析显示毒株LN2017是一个重组病毒,在E3基因区域和HAdV-2发生了重组,重组区域位于28045-31042。本研究首次证实了LN2017与GenBank中的JX173080(埃及株E13)、MH183293(上海株SH2016)和MH121110(德国株43C1)具有相同的重组方式,在HAdV-1内构成一个独立的分支。未来,有必要对该分支人腺病毒1型重组株的致病性和临床特征进行进一步研究,并继续加强对HAdV的分子流行病学监测。

关键词(KeyWords): 急性弛缓性麻痹(AFP);人腺病毒1型重组株;全基因组;E3基因

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): “十三五”国家科技重大专项课题(项目号:2017ZX10103007),题目:辽宁及周边省市传染病病原谱流行规律研究~~

作者(Author): 邵玉平;王作虪;任丽萍;陈涛;方兴;任毅;郝爽;王文思;姚文清;

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DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003948

参考文献(References):

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