病毒学报

2021, v.37(05) 1102-1111

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2010-2019年北京地区腹泻患儿中人腺病毒41型Fiber基因分子特征和进化分析
Genetic Variation and Molecular Evolution of the Fiber Gene of Human Adenovirus Serotype 41 Strains in Children Suffering from Diarrhea During 2010–2019 in Beijing,China

刘立颖;钱渊;贾立平;董慧谨;朱汝南;

摘要(Abstract):

人腺病毒41型(Human adenovirus 41,HAdV-41)是引起儿童腹泻的重要病原之一。为了解北京地区腹泻儿童中HAdV-41 Fiber基因的分子变异和遗传进化特征,选取2010-2019年首都儿科研究所附属儿童医院门诊腹泻患儿HAdV-41阳性的粪便标本,扩增Fiber全基因,使用多种生物信息学软件进行系统发生、遗传进化、种群演变和选择压力等分析。结果显示HAdV-41本地毒株存在1 644碱基(547氨基酸)和1 689碱基(562氨基酸)两种长度的Fiber基因,截短的15个氨基酸位于Fiber蛋白纤维轴区。Mann-Whitney U秩和检验提示检测到感染短Fiber基因的HAdV-41的患儿年龄更小(P=0.036)。同源性分析结果显示Fiber基因的核苷酸和氨基酸序列同源性均大于97%,主要分为四个进化分支(Ⅰ、II、Ⅲ和Ⅳ),其中Ⅰ和Ⅲ是主要的流行分支,分支Ⅰ主要在国内流行,而分支Ⅲ全球均有流行。HAdV-41共祖起源可追溯到1856年,平均进化速率每年为6.81×10-5碱基替换/位点,10年间理论有效种群一直比较平稳呈缓慢下降趋势。压力选择分析表明,一个正向和三个负向选择位点均位于Fiber蛋白的纤维轴区。上述结果表明2010-2019年间不同进化分支的HAdV-41在北京地区流行,进化速率稳定。Fiber蛋白轴区存在两种不同类型的氨基酸缺失。

关键词(KeyWords): 人腺病毒41型(HAdV-41);纤维蛋白;腹泻;分子进化

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金青年基金(项目号:81401705),题目:外壳蛋白penton和Fiber在腺病毒31型嗜肠道感染中的作用及机制研究;; 首都儿科研究所所级基金(项目号:FX-2018-02),题目:腺病毒31型外壳蛋白Fiber抗原表位的研究~~

作者(Author): 刘立颖;钱渊;贾立平;董慧谨;朱汝南;

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DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003959

参考文献(References):

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